Được gọi là Honda City X, phiên bản giới hạn này được trang bị ghế bọc da thay vì ghế vài như trên bản tiêu chuẩn. Biểu tượng chữ X được dập nổi trên các ghế ngồi, trên thân xe và trên nắp động cơ. Sẽ chỉ có 450 Honda City X được sản xuất.
Không có sự thay đổi về trang bị động cơ trên City, điều này có nghĩa là phiên bản giới hạn sẽ vẫn sử dụng động cơ 1.5 lít SOHC cho công suất tối đa 118 mã lực tại vòng tua máy 6.600 vòng/phút và 145 Nm tại 4.600 vòng/phút đi kèm là hộp số CVT.
Về trang bị an toàn City X sở hữu: Hệ thống chống bó cứng phanh ABS, hệ thống EBD, hệ thống hỗ trợ phanh khẩn cấp, hệ thống cân bằng xe điện tử, hệ thống hỗ trợ khởi hành ngang dốc, túi khí kép…
Không giống như phiên bản cơ sở, Honda City X chỉ có 2 tùy chọn màu sơn là xám kim loại và đỏ. Tại thị trường Malaysia, Honda City X có giá từ 86,100 RM tương đương khoảng 469 triệu đồng.